生物信息学 Bioinformatics 陈铭

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书籍概况

《生物信息学(第四版)》是科学出版社于2022年3月1日出版的权威教材,主编为陈铭教授。该书ISBN为978-7-03-071906-5,总页数404页,定价69.80元。全书在国内外生物信息学教学和研究领域具有广泛影响力,已被多所高校选作本科生与研究生的核心教材📚。

陈铭教授长期从事生物信息学教学与科研,尤其在序列分析、结构预测与系统生物学领域具有深厚造诣,其主持编写的本书充分结合最新学科发展动态,为读者提供了详实、深入的理论与应用指导🔬。

内容结构

全书共十四章,按照由浅入深的逻辑次序安排:

  1. 「生物信息学的概念及发展历史」:回顾学科起源、研究领域与应用前景。
  2. 「生物学数据库及其检索」:介绍主要公共数据库、数据存储格式与检索技巧。
  3. 「序列比对原理」:涵盖打分方法、算法原理及常用工具;并拓展多序列比对技术。
  4. 「蛋白质结构预测与分析」:从组织层次到折叠机制,探讨计算预测与实验测定方法。
  5. 「基因组学」:基因注释、重复序列与假基因分析,并辅以黄瓜基因组案例。
  6. 「转录组学」:RNA-seq流程、数据处理及功能注释策略。
  7. 「非编码RNA」:miRNA、lncRNA、circRNA等分类与功能解析。
  8. 「蛋白质组学」:高通量鉴定技术、翻译后修饰与相互作用网络。
  9. 「系统生物学」:网络构建、代谢与信号通路模型、虚拟细胞技术。
  10. 「合成生物学」:原理、基础与应用实例,结合化学视角阐释生命系统设计。
  11. 「分子进化与系统发育」:进化模型、系统发育树构建方法及应用。
  12. 「统计学习与推理」:聚类、主成分、贝叶斯推理、隐马尔可夫模型及深度学习应用。
  13. 「生物信息学编程基础」:Linux、Python/R、SQL与并行计算实战。
  14. 「新一代测序技术及其应用」:第二代测序原理、应用流程及未来发展趋势。

核心特色

  • 「多校联合编写」:汇聚四十余所高校专家力量,内容兼顾理论深度与教学可操作性📘。
  • 「丰富的辅助资源」:在章节中嵌入二维码,链接视频讲解和在线数据库,支持移动学习与在线实验演示📱。
  • 「案例驱动」:结合真实生物组学项目案例,如黄瓜基因组注释与RNA-seq分析,增强实战经验🧬。
  • 「跨学科融合」:不仅涵盖分子生物学与计算方法,还引入统计学习、系统生物学与合成生物学视角,适应现代交叉研究需求🔗。

学习与研究价值

对于生物信息学初学者,本书提供了系统的入门指导与思考题,有助于构建完整知识体系;对于中高级研究者,则可作为工具与方法的参考手册,快速查阅算法原理与实践案例。书中大量参考文献与附录信息,有利于进一步深入探索特定领域📑。

此外,本书对统计学习与深度学习在组学数据中的应用做了前瞻性介绍,为研究者在大数据时代开展多组学整合分析提供了理论与实践支持💻。

使用建议

  1. 「教材模式」:可按章节顺序逐步学习,完成思考题和编程实践;
  2. 「自学模式」:根据研究方向选取相关章节,结合在线资源与视频材料,灵活研读;
  3. 「研讨模式」:在读书会上组织章节分享与案例讨论,促进学术交流与团队协作🤝。

结语

总之,陈铭教授主编的《生物信息学(第四版)》是一部兼具理论深度与应用广度的专业教材,既为生物信息学教学提供了标准化课程框架,也为研究者在组学分析和算法开发领域提供了丰富工具和案例。希望广大同学与科研人员能够充分利用本书和配套资源,在生物信息学研究道路上不断探索、勇攀高峰!🚀🧪

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