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Structural Bioinformatics 结构生物信息学, P. E.
波恩 H.魏西希
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概述
《Structural Bioinformatics 结构生物信息学》由Philip E. Bourne与Helge Weissig主编，是结构生物信息学领域的权威专著，首次出版于2003年，后有第二版推出。本书系统地介绍了结构生物信息学的理论基础、主要算法、数据库资源及软件工具，并深入探讨了蛋白质、核酸及复杂生物大分子的三维结构分析与功能研究方法。作为结构生物学与计算生物学的桥梁，这部著作兼具理论深度与实践指导意义，既适合作为博士研究生及科研人员的参考书，也可用作高年级本科生和硕士生的核心教材😃。
书籍背景与定位
本书由两位海内外知名学者主编：Philip E. Bourne在结构生物学与生物信息学领域发表过百篇论文，并担任多项国际学术职务；Helge Weissig则在生物信息学项目开发方面经验丰富，两位作者的学术积累为本书奠定了坚实基础。2003年首版由Wiley-Liss出版，包含672页内容，涵盖结构数据获取、分析、比较和可视化等主题，售价约69.95美。
出版与版本
- 「出版社与时间」：首版由Wiley-Liss于2003年2月发行；第二版于2007年更新，由Wiley出版，篇幅与内容均有扩展。
- 「版式与长度」：首版为平装本，656页；第二版增加了最新算法与案例，篇幅略增。
- 「ISBN」：0471201995（首版）。
内容与章节结构
本书共分为五大部分，全面覆盖结构生物信息学各重要方面🔍：
一、结构数据与数据库
介绍蛋白质结构数据库（如PDB）的组织方式和访问方法，详述数据格式、注释信息与获取策略，为后续分析提供原始数据基础。
二、结构比较与对齐
系统讲解结构比对算法，包括RMSD计算、基于距离矩阵的比对方法及多结构比对技术，并介绍多种流行软件（如DALI、CE、MUSTANG）的原理与应用示例。
三、结构预测与建模
涵盖同源建模、断裂环建模、分子动力学模拟等前沿方法，讨论模型质量评估指标（如GDT、MaxSub）及实际操作中常用的调参技巧。
四、功能注释与药物设计
探讨如何结合结构信息进行功能预测、活性位点识别、药物分子对接（Docking）以及基于结构的药物设计策略，为转化医学提供思路🧬。
五、软件工具与实践
以实例为导向，详细介绍多款开源及商业软件的使用，包括PyMOL、UCSF Chimera、MODELLER等，并附带脚本示例和操作指南，帮助学生和研究者快速上手🔬。
主要特色与亮点
- 「理论与实践结合」：每章均配有实际案例与习题，鼓励读者动手实践，从而加深对算法原理和工具应用的理解📚。
- 「跨学科视角」：不仅探讨生物学问题，也融入计算机科学、数学和物理学思维，适合电子工程及数据科学背景的读者拓展研究视野💡。
- 「前沿内容更新」：第二版新增结构预测和分子模拟新技术介绍，紧跟研究热点，保证读者掌握最新方法。
- 「资源丰富」：书末附有大量数据库与软件工具的网址列表，便于读者进一步学习与探索🔗。
适用读者与学习建议
- 「本科高年级与硕博研究生」：可将本书作为结构生物信息学课程教材，结合课堂讲解与书中习题体系化学习。
- 「科研人员与工程师」：作为参考书使用，迅速查找所需方法细节，并借助实例代码实现具体分析流程。
- 「跨学科团队成员」：物理、化学、计算机等背景的研究者可通过本书了解生物问题，促进团队协作与项目开展。
❝「学习建议」：建议读者在学习过程中，配合Python或R等编程语言实践书中示例，并在开源平台（如GitHub）查找相关脚本，以加深理解并积累实战经验。
❞
结语
总之，《Structural Bioinformatics 结构生物信息学》凭借其系统全面的内容、理论与实践并重的编写风格，以及丰富的资源支持，是结构生物信息学领域不可或缺的经典之作📖。无论是初学者还是资深研究者，均能从中受益，为未来的科研工作打下坚实基础。祝愿每位读者在探索三维生物大分子结构与功能的道路上，取得丰硕成果！😊
❝You can get PDF via Link
❞ Structural Bioinformatics
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